Les coûts prévisibles de désaffectation et de gestion des déchets sont réévalues tous les cinq ans par swissnuclear, sur mandat des exploitants de centrales nucléaires, et une étude de coûts détaillée est élaborée. Si des circonstances imprévues laissent présager une modification substantielle des coûts, un nouveau calcul peut être effectué avant l'expiration de ce délai de cinq ans.
Les coûts sont déterminés sur la base des plans de désaffectation, du programme de gestion des déchets radioactifs de la Nagra approuvé par le Conseil fédéral, des connaissances technico-scientifiques les plus récentes ainsi que des prix en vigueur au moment du calcul. Cela permet de garantir que les nouvelles connaissances, par exemple en rapport avec la désaffectation de centrales nucléaires en Suisse et à l’étranger ou avec l'exploitation minière et la construction de tunnels pour la construction de dépôts géologiques en profondeur, sont prises en compte et que les prévisions de coûts correspondantes sont mises à jour tous les cinq ans.
L'étude de coûts est soumise à STENFO et à l'Inspection fédérale de la sécurité nucléaire IFSN. L'IFSN examine ensuite l'étude de coûts en ce qui concerne les aspects pertinents pour la sécurité et établie le rapport de sécurité. Sous la direction du comité en charge des coûts, des experts internationaux indépendants examinent à leur tour l'étude de coûts en ce qui concerne le calcul des coûts, après quoi le comité en charge des coûts établit son rapport d'audit. Le Département fédéral de l'environnement, des transports, de l'énergie et de la communication DETEC émet ensuite un avis sur l'étude de coûts et le rapport d'audit. Enfin, la commission administrative fixe le montant prévisible des coûts de désaffectation et de gestion des déchets pour chaque centrale nucléaire, en se basant sur l’étude de coûts, le rapport de sécurité, le rapport d'audit et en tenant compte de la prise de position du DETEC.